โตเกียวมีตัวเลือกที่พักราคาประหยัดมากมาย โดยเฉพาะย่านอุเอโนะและอาซากุสะ ซึ่งเป็นศูนย์กลางการเดินทางและแหล่งท่องเที่ยวสำคัญ โรงแรมเหล่านี้ส่วนใหญ่ตั้งอยู่ภายในระยะเดินถึงสถานีรถไฟหลัก เช่น JR Ueno, Keisei Ueno และ Asakusa Station ทำให้สะดวกในการเดินทางไปยังชินจูกุ อาซากุสะ หรือสนามบินนาริตะ แม้จะเป็นโรงแรมประหยัด แต่ก็มีสิ่งอำนวยความสะดวกครบครัน เช่น WiFi ฟรี เครื่องซักผ้าหยอดเหรียญ และอาหารเช้าแบบง่ายๆ
ตัวอย่างเช่น Remm Akihabara อยู่ติดสถานี JR Akihabara ห้องพักมีหน้าต่างบานใหญ่และห้องน้ำกระจกพร้อมฝักบัวเรนฟอลล์ Hotel Sardonyx Ueno มีอาหารเช้าฟรีสไตล์ตะวันตก ส่วน Landabout Tokyo มีบาร์และร้านอาหารให้บริการ ในย่านอาซากุสะ Hop Inn Tokyo Asakusa อยู่ใกล้ประตู Hozomon และวัดเซ็นโซจิ สำหรับนักเดินทางที่ต้องการทำเลที่ดีและราคาไม่แพง โรงแรมเหล่านี้เป็นตัวเลือกที่คุ้มค่า
