โตเกียวมีที่พักสำหรับครอบครัวหลากหลายระดับ ตั้งแต่โรงแรมหรูอย่าง Park Hyatt Tokyo ในชินจูกุที่มีวิวสวยและสระว่ายน้ำในร่ม ไปจนถึง Imperial Hotel Tokyo ใกล้ย่านกินซ่าและสวนพระราชวัง ที่มีห้องครอบครัวและสระว่ายน้ำให้เด็กๆ ได้เล่น ส่วน The Peninsula Tokyo ก็มีสปาและสโมสรออกกำลังกาย เหมาะสำหรับครอบครัวที่ต้องการความสะดวกสบาย ราคาห้องต่อคืนเริ่มต้นประมาณ 5,000-50,000 เยน ขึ้นอยู่กับประเภทห้องและสิ่งอำนวยความสะดวก
สำหรับครอบครัวที่ต้องการประหยัดงบ มี Belle Via Tokyo Hostel และ Hop Inn Tokyo Asakusa ซึ่งมีห้องครอบครัวพร้อมสิ่งอำนวยความสะดวกพื้นฐาน ใกล้แหล่งท่องเที่ยวอย่างวัดเซ็นโซจิและย่านอาซากุสะ ข้อแนะนำคือควรเลือกที่พักใกล้สถานีรถไฟเพื่อความสะดวกในการเดินทาง เช่น ชินจูกุ อุเอโนะ หรืออาซากุสะ โรงแรมส่วนใหญ่ให้บริการ WiFi ฟรีและที่จอดรถ ครอบครัวที่มีเด็กเล็กควรสอบถามเรื่องเตียงเสริมหรือห้องเชื่อมต่อกันล่วงหน้า