ที่พักติดทะเลบนเกาะหลีเป๊ะมีให้เลือกตั้งแต่รีสอร์ทระดับกลางไปจนถึงระดับ 5 ดาว กระจายอยู่ตามชายหาดหลักอย่างหาดซันไรส์ (Sunrise Beach) หาดพระอาทิตย์ตก (Sunset Beach) และหาดปาต้าย (Pattaya Beach) ราคาห้องพักเริ่มต้นประมาณ 1,500 บาทต่อคืนสำหรับบังกะโลเรียบง่าย และสูงถึง 15,000 บาทสำหรับวิลล่าส่วนตัวพร้อมสระว่ายน้ำ โรงแรมส่วนใหญ่อยู่ในระยะเดินถึงถนนคนเดินและท่าเรือ รีสอร์ทหลายแห่งมีสิ่งอำนวยความสะดวกครบ เช่น บริการนวด ชายหาดส่วนตัว อุปกรณ์ดำน้ำดูปะการัง และ Wi-Fi ฟรี นักท่องเที่ยวควรจองล่วงหน้าโดยเฉพาะในช่วงไฮซีซั่น (พฤศจิกายน-เมษายน) และเตรียมเงินสดเนื่องจากตู้ ATM มีจำกัดบนเกาะ
สำหรับรีสอร์ทที่ได้รับคะแนนสูงสุด Serendipity Beach Resort Koh Lipe ให้คะแนน 9.0 จาก 10 มีชายหาดส่วนตัวและ Wi-Fi ฟรีในพื้นที่ส่วนกลาง เหมาะกับคู่รักที่ต้องการความเป็นส่วนตัว Akira Lipe Resort ติดหาดปาต้าย มีสระว่ายน้ำ 3 สระ ฟิตเนส และคลับเด็ก ตอบโจทย์ครอบครัว Irene Pool Villa Resort, Koh Lipe เป็นโรงแรม 5 ดาวติดทะเลพร้อมวิลล่าส่วนตัวที่มีสระว่ายน้ำ วิวทะเล เหมาะสำหรับผู้ที่มองหาความหรูหรา Castaway Resort Koh Lipe ตั้งอยู่บนหาดซันไรส์ บังกะโลไม้สไตล์ไทยระบายอากาศดี ราคาประหยัดกว่า เหมาะกับนักเดินทางแบ็คแพ็คหรือคนรักธรรมชาติ