พัทยาไม่ได้มีเพียงโรงแรมขนาดใหญ่เท่านั้น แต่ยังเต็มไปด้วยโรงแรมบูติกที่เน้นการออกแบบเฉพาะตัวและบรรยากาศที่เป็นส่วนตัว โรงแรมเหล่านี้มักตั้งอยู่ในย่านสำคัญ เช่น พัทยากลาง พัทยาเหนือ และนาเกลือ ซึ่งใกล้ชายหาดและแหล่งช้อปปิ้งอย่างเซ็นทรัลเฟสติวัล พัทยา บีช ราคาห้องพักเริ่มต้นประมาณ 1,200 บาทต่อคืน ขึ้นอยู่กับทำเลและสิ่งอำนวยความสะดวก โรงแรมบูติกส่วนใหญ่มี Wi-Fi ฟรี สระว่ายน้ำกลางแจ้ง และห้องอาหารในโรงแรม เหมาะสำหรับนักท่องเที่ยวที่ต้องการประสบการณ์ที่แตกต่างและใส่ใจในรายละเอียด
ตัวอย่างโรงแรมบูติกยอดนิยมในพัทยา ได้แก่ Holiday Inn Pattaya ซึ่งตั้งอยู่ติดชายหาดพัทยา มีสระว่ายน้ำ infinity 2 สระ และคลับเฮาส์สำหรับเด็ก หรือ Pullman Pattaya Hotel G ที่มีสถาปัตยกรรมไทยผสมผสานโมเดิร์น พร้อมสระว่ายน้ำขนาดใหญ่และสปา ส่วน Hilton Pattaya ตั้งอยู่บนห้างเซ็นทรัลเฟสติวัล ให้วิวอ่าวพัทยา 360 องศา และสระว่ายน้ำ infinity ระดับ 5 ดาว สำหรับครอบครัว Centara Grand Mirage Beach Resort Pattaya มีธีมสวนน้ำริมชายหาด และ Amari Pattaya มีโซนผู้ใหญ่และสวนน้ำเด็กแยกจากกัน ควรจองล่วงหน้าเพื่อรับราคาพิเศษ โดยเฉพาะช่วงเทศกาล
