รีสอร์ทบนเกาะหลีเป๊ะมีให้เลือกตั้งแต่แบบประหยัดไปจนถึงระดับ 5 ดาว กระจายตัวอยู่ตามชายหาดหลักอย่างซันไรส์บีช (Sunrise Beach) พัทยาบีช (Pattaya Beach) และซันเซ็ทบีช (Sunset Beach) ราคาห้องพักเริ่มต้นประมาณ 1,000 บาทต่อคืน โดยรีสอร์ทส่วนใหญ่เป็นแบบบังกะโลหรือวิลล่า ตั้งอยู่ติดทะเล พร้อมสิ่งอำนวยความสะดวกพื้นฐาน เช่น WiFi ฟรี อาหารเช้า และบริการนวดแผนไทย การเดินทางในเกาะสามารถเดินเท้าหรือใช้บริการเรือท้องแบนได้สะดวก
รีสอร์ทที่ได้รับคะแนนสูงสุดบนเกาะหลีเป๊ะ ได้แก่ Serendipity Beach Resort Koh Lipe (คะแนน 90) กับห้องพักส่วนตัวและพื้นที่ชายหาดส่วนตัว Akira Lipe Resort (คะแนน 92) ที่มีสระว่ายน้ำถึง 3 สระ รวมถึงสระว่ายน้ำแบบ Swim-up Bar และ Bulow Casa Grand View Resort (คะแนน 92) โรงแรมระดับ 5 ดาวพร้อมอ่างจากุซซี่และวิวทะเล นอกจากนี้ยังมี Castaway Resort Koh Lipe (คะแนน 87) ที่ออกแบบบังกะโลไม้สไตล์ไทยรับลมทะเล และ Mountain Resort Koh Lipe (คะแนน 87) ซึ่งตั้งอยู่บนเนินเขามองเห็นวิวพระอาทิตย์ตก ควรจองล่วงหน้าในช่วงเทศกาลเพื่อให้ได้ห้องในราคาที่เหมาะสม